Diagnóstico microbiológico

 Índice extendido  xvii

Aspectos básicos de la PCR

145

Estructuras de la superficie bacteriana

194 194 194 195 195

Aplicaciones clínicas 146 Otros métodos de amplificación de ácidos nucleicos 147 Aplicaciones clínicas 148 Modificaciones de la PCR 148 PCR por transcripción inversa 148 PCR de amplio espectro 149 PCR múltiple 150 PCR con cebadores internos 150 Análisis postamplificación 151 Métodos tradicionales de detección 151 Análisis de electroforesis en gel/Southern blot 151 Detección enzimática de productos amplificados 152 Hibridación inversa 152 Aplicaciones clínicas 152 Secuenciación de ADN 152 Secuenciación tradicional de ADN 153 Secuenciación por síntesis (pirosecuenciación) 154 Secuenciación de nueva generación 155 Análisis de microarreglos 155 Amplificación de ácidos nucleicos en tiempo real 156 Métodos para detección de productos de amplificación en tiempo real 156 Verde SYBR 156 Colorantes de unión al ADN de nueva generación 157 Sondas de hibridación 157 Aplicaciones clínicas 159 Tipificación de cepas 161 Tipificación no basada en amplificación 161 Electroforesis en gel de campo pulsado 161 Tipificación basada en amplificación 162 PCR-RFLP 162 Rep-PCR 163 Aplicaciones clínicas de la tipificación microbiana 163 Espectrometría de masas 163 Conclusión 165 CAPÍTULO 5 Bacteriología médica: taxonomía, morfología, fisiología y virulencia Taxonomía: clasificación, nomenclatura e identificación de bacterias 173 Denominación de las bacterias 174 Identificación fenotípica de las bacterias 175 Criterios filogénicos para la clasificación de las bacterias 176 Anatomía y fisiología bacteriana básica 182 Tamaño y forma bacteriana 182 Estructura nuclear, replicación, transcripción y traducción del ADN 183 Citoplasma 186 Membrana citoplasmática 187 Estructura de la pared celular bacteriana 187 Paredes celulares de las bacterias grampositivas 188 Paredes celulares de las bacterias gramnegativas 189 Paredes celulares de las bacterias “ácido alcohol resistentes” 192 Endosporas bacterianas 193

Cápsulas Flagelos

Otros orgánulos locomotores

Fimbrias (pili)

Intercambio genético y recombinación en las bacterias Requerimientos para el crecimiento y metabolismo bacteriano

196

198 198 198 199 199 199 200 201 201 202 205 205 206 207 207 207 208 210

Carbono

Dióxido de carbono

Oxígeno

Nitrógeno

Factores de crecimiento

Cinética del crecimiento celular bacteriano Metabolismo bacteriano general y generación de energía

Fermentación

Utilización de piruvato

Factores de virulencia bacterianos y patogenia Definiciones y conceptos Requerimientos para la patogenia Factores de virulencia de las bacterias

Adhesinas Agresinas

Exotoxinas y endotoxinas Superantígenos bacterianos

CAPÍTULO 6 Enterobacteriaceae Características para la identificación presuntiva Características para la detección precoz

214 214 215 217 217

Utilización de hidratos de carbono Actividad de la citocromo-c-oxidasa

Reducción de nitratos

Medios de cultivo utilizados para detectar la fermentación de hidratos de carbono Utilización de agar hierro de Kligler y agar hierro triple azúcar

218

218 219 220 AMPLE Principios bioquímicos Selección de medios de aislamiento primario Sustancias químicas y compuestos utilizados en medios selectivos Medios de aislamiento selectivos 220 220 Medios de aislamiento de alta selectividad utilizados principalmente para muestras gastrointestinales 222 Medios de enriquecimiento 223 Directrices para elegir medios de aislamiento selectivos 224 Características de identificación diferencial 224 Producción de indol 225 Prueba de rojo de metilo 226 Prueba de Voges-Proskauer 226 Utilización de citrato 226 Producción de ureasa 226 Descarboxilación de lisina, ornitina y arginina 227 Producción de fenilalanina desaminasa 227 Producción de sulfuro de hidrógeno 227 Motilidad 228